电磁流量计作为一种基于法拉第电磁感应定律工作的流量测量设备，虽然具有诸多优点，如测量准确、无压力损失、耐腐蚀等，但也存在一些缺点。以下是电磁流量计的主要缺点：电磁流量计只能测量导电介质的液体流量，不能测量非导电介质的流量，如气体、蒸汽或电导率极低的液体（如蒸馏水、石油制品、有机溶剂等）。这是因为电磁流量计的工作原理依赖于被测介质的导电性，如果介质的电导率过低，则无法产生足够的感应电动势，进而影响测量准确度。电磁流量计的安装与调试相比其他流量计更复杂，且要求更严格。安装地点不能有振动，不能有强磁场，且必须使变送器和管道有良好的接触及良好的接地。此外，在使用时必须排尽测量管中存留的气体，否则会造成较大的测量误差。
易受电磁干扰：电磁流量计的传感器信号较小，容易受到外界电磁干扰的影响，这可能会引起测量结果的波动或误差。因此，在安装和使用的过程中需要非常注意避免电磁干扰。维护成本比较高：电磁流量计是一种精密设备，需要按时进行检查和清洁以确保其正常工作并延长常规使用的寿命。如果测量介质中含有污垢，电极上污垢物达到一定厚度可能会引起仪表测量误差加大，进一步增加了维护成本。测量误差可能较大：在某些情况下，如液体中含有较多气泡或固体颗粒时，电磁流量计的测量误差可能较大。此外，当测量流体中的电导率发生明显的变化时，也会影响测量结果。受温度限制：由于测量管绝缘衬里材料受温度的限制，电磁流量计可能没办法直接用于测量高温度高压力流体。这限制了其在某些极端工况下的应用。价格相对较高：相对于别的类型的流量计，电磁流量计的价格通常较高。这还在于其采用了先进的测量技术和精密的制造工艺。电磁流量计在选型和使用时应该要依据具体的应用场景和需求来做综合考虑，以充分的发挥其优点并尽可能的避免其缺点的影响。
